במצב של קרטוקונוס קרנית העין מתוחה, דקה ועשויה להשתנות.
לכן אסור לבצע ניתוח ליזר להסרת משקפים במצב זה.
לאחרונה עלה לדיון נושא של ניתוח להסרת משקפיים בקרנית שעברה טיפול קרוס-לינקינג, אולם הדבר עדיין שנוי במחלוקת ונמצא בשלבי מחקר.
במצב של קרטוקונוס קל ניתוח הסרת משקפיים עלול להחמיר אותו, ולכן יש לוודא היטב לפני כל ניתוח שכזה שאין קרטוקונוס מכל סוג בקרנית, גם קרטוקונוס קל, זאת על ידי מיפוי קרנית במכון הלייזר או באופן פרטי.
במקרים נדירים בהם ניתוח הסרת משקפיים הינו הכרחי למטופל עקב מרשם יחודי, מבנה פנים שלא מאפשר משקפיים, יובש שלא מאפשר הרכבת עדשות, ובמקרי קרטוקונוס קלים לאחר גיל 40, ניתן לשקול יחד עם הרופא המטפל את ביצוע ניתוח הסרת המרשם.
